Recherche en santé publique





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Master 2 de Santé Publique



RECHERCHE en santé publique




Laurence MEYER




Université Paris Sud

Fascicule des Enseignements
Septembre 2015

Année universitaire 2015 - 2016

TABLE DES MATIÈRES

Organisation générale du Master 2 …………………………………..… p. 3 à 4
Mises à niveau ……………………………………………………….…… p. 5 à 6
Description des 4 options
 Biostatistique ..……………………………………………………... p. 7 à 8
 Organisations et Systèmes de Santé……………………… p. 9 à 10
 Épidémiologie ……………………………….…………….……… p. 11 à 12
 Recherche clinique ………………………...……………………… p. 13 à 14
Description des modules ………………………...………………………… p. 15 à 48
Laboratoires d’accueil …………………………………..………………… p. 49 à 58
Renseignements .………………………………….…….……..……………. p. 59


Master 2 de Santé Publique

Recherche en Santé Publique




Universités Paris Sud, Paris Descartes, Paris-Est Créteil

et UVSQ
Organisation GÉnÉrale DU M2 R

Année universitaire 2015-2016

Le Master 2 de Santé Publique Recherche en Santé Publique est cohabilité par les Universités Paris Sud, Paris Descartes, Paris–Est Créteil et UVSQ. La formation dispensée dans le cadre du M2 Recherche peut être suivie dans le cadre de quatre options :





Biostatistique




Organisations et Systèmes de Santé




Épidémiologie




Recherche clinique


Elle comporte trois parties :
Un ensemble de "Mises à niveau" : enseignées sur 2 semaines du Vendredi 18 Septembre au Vendredi 2 Octobre 2015 et proposées aux étudiants en fonction de leur formation antérieure et de l’option choisie du M2 (cf ci-après).
Un ensemble de "Modules de cours" : enseignés sur 11 semaines du Lundi 5 Octobre 2015 au Vendredi 8 Janvier 2016 (15 Janvier 2016 pour l’option Biostatistique). Certains d'entre eux sont communs à toutes les options, d'autres à deux ou trois d'entre eux et certains spécifiques à une option. De plus, les étudiants d’une option choisissent un module d’une autre option dans une liste qui leur est proposée.
Un stage dans un laboratoire de recherche : Le stage de M2 R a lieu dans l'un des laboratoires d'accueil du M2 R (cf liste à la fin de ce fascicule). Le sujet du stage est défini en accord avec les responsables de l’option en Octobre. Le stage se déroule de début-Janvier à fin-Juin  à temps plein ou de Janvier à Septembre à mi-temps. Il est cependant conseillé de le débuter le plus tôt possible même s’il ne s’agit que de quelques heures par semaine pendant la période de cours en automne. Il donne lieu à la remise d'un document écrit. Une "présentation orale intermédiaire" de l'avancement des travaux a lieu fin-Mars début-Avril et les soutenances ont lieu devant un jury.

Les enseignements du M2 R se déroulent principalement selon les parcours :


  • dans les locaux de l’UFR de Médecine Paris Sud, CHU du Kremlin-Bicêtre, 63 rue Gabriel, 94276 Le Kremlin-Bicêtre – M° Le Kremlin Bicêtre.



  • dans les locaux du CESP de l'Hôpital Paul-Brousse, Bâtiment 15/16 av. Paul Vaillant-Couturier, - secteur Violet - 94807 Villejuif – M° Villejuif Paul Vaillant Couturier.




  • dans les locaux de l’Université Paris Descartes, bâtiment des Sts-Pères, 45 rue des Saints-Pères, 75006 Paris pour l’option Biostatistique.



Master 2 de Santé Publique Recherche en Santé Publique

MISES À NIVEAU

2015 - 2016



Données Censurées (9 heures) - Yann de Rycke

- Destinée aux étudiants n’ayant pas suivi de formation d’analyse de données de survie

- Données censurées, méthode de Kaplan-Meier, méthode du log-rank

- Exercices et problèmes

Épidémiologie (9 heures) - Laurence Meyer

- Destinée aux étudiants de toutes les options dont la formation n’a pas inclus l’équivalent d’un module d’épidémiologie de niveau M1 Santé Publique. Cette mise à niveau comprend les différentes notions suivantes :
- Les grands types d’enquêtes épidémiologiques

- Les mesures de fréquence

- Les mesures d’association

- Biais de sélection, de mesure

- Confusion et interaction.

Essais Thérapeutiques (6 heures) - Marie Cécile Le Deley, Yann de Rycke

- Destinée aux étudiants n'ayant pas suivi l’UE de Recherche Clinique du M1 Santé Publique ni le STARC

- La démarche expérimentale dans l'évaluation d'un nouveau traitement

- L'essai randomisé de sa planification à l’analyse

- Les risques d'erreur, le nombre de sujets nécessaires

- Essais de supériorité, d'équivalence, de non infériorité

Logiciels (21 heures) - Guillaume Dussaillant, Anne Persoz, Jean-Paul Téglas

Selon les besoins des étudiants, initiation à UNIX, SAS, STATA, R.

Matrices (9 heures) - Mohammed Sedki

- Destinée à tous les étudiants.

La mise à niveau de calcul matriciel doit permettre aux étudiants de comprendre et d’utiliser les notations matricielles. Elle est construite sur la présentation matricielle de la régression linéaire et de l’estimateur des moindres carrés.

- Premières définitions, matrices et vecteurs

- Opérations (addition, multiplication, multiplication par un nombre, transposition)

- Déterminant d’une matrice carrée

- Inverse d’une matrice carrée régulière, inverse généralisée

- Interprétation géométrique

- Valeurs et vecteurs propres

- Diagonalisation d’une matrice carrée

- Formes quadratiques

- Dérivées matricielles

- Matrices des variances-covariances et des corrélations

Méthodologie de l'Analyse critique de la Littérature (3 heures) - Antoine Rachas

- Destinée à tous les étudiants

Probabilités et Statistiques (12 heures) - Mohammed Sedki

- Destinée à tous les étudiants sauf ceux de l’option Biostatistique

- Rappel élémentaire des principes et des formules de base du calcul des probabilités : formule de Bayes, principales lois de probabilités, transformations de variables. Eléments de statistique descriptive et rappels des tests usuels.

Sociologie de la santé (6 heures) - Myriam Winance

Cet enseignement est destiné aux étudiants de l’option Organisations et Systèmes de Santé dont la formation antérieure n'a pas inclus de sociologie de la santé. Cette mise à niveau portera sur les concepts de base et les principaux auteurs dont la connaissance est nécessaire pour réaliser des recherches qualitatives dans le champ de la santé. L'objectif sera de faire un panorama de la discipline, donnant aux étudiants les repères pour ensuite approfondir les thématiques qui les intéresseront dans le cadre de l’option.

Les étudiants des autres options peuvent le suivre.



Master 2 de Santé Publique Recherche en Santé Publique :

option "Biostatistique" UE 4-1



Responsables :

Chantal GUIHENNEUC (Université Paris Descartes)

Mohammed SEDKI (Université Paris Sud)

Pascale TUBERT-BITTER (Inserm - UMR 1181)

L’option « Biostatistique » fournit une formation approfondie aux méthodes statistiques récentes orientée vers leurs applications en épidémiologie, recherche clinique et santé publique.

Il s’adresse à des étudiants

- de formation mathématique et statistique et intéressés par les applications biomédicales
- de formation biomédicale (médecine, dentaire, pharmacie, école vétérinaire, biologie, agronomie) intéressés par les problèmes méthodologiques et ayant reçu une formation complémentaire en statistique.

L’objectif est de permettre aux étudiants de maîtriser les fondements théoriques des méthodes et leur mise en œuvre afin qu’ils soient capables de participer à l’évolution des techniques statistiques induites par la complexité croissante des données. Les débouchés concernent à la fois :

- avec ou sans thèse : l’administration (agences ou observatoires de veille et de sécurité sanitaires), le secteur hospitalier (unités de recherche clinique, départements d’information médicale, ...), le secteur privé (industrie pharmaceutique et sociétés de service).

- après une thèse : les carrières académiques (université, instituts de recherche)

Le programme des cours du Master 2 de Santé Publique Recherche en Santé Publique comprend des modules obligatoires spécifiques au parcours « Biostatistique » ou communs à d’autres parcours et des modules optionnels.


La formation à la recherche est assurée par un stage dont la durée est équivalente à 6 mois temps plein de mi-novembre à fin juin ou 9 mois à mi-temps de mi-novembre à septembre et qui se déroule dans un laboratoire de recherche agréé par le Master 2 de Santé Publique Recherche en Santé Publique. Le stage donne lieu à la rédaction d'un mémoire et à une soutenance devant un jury.

Une discussion sur la faisabilité du sujet du mémoire a lieu début janvier ; une présentation intermédiaire des premiers résultats se déroule fin-mars début-avril.

Master 2 de Santé Publique Recherche en Santé Publique :

option "Biostatistique" UE 4-1



Modules spécifiques :


BiostatR

Biostatistique avec R

8 séances

12h00

C. Pouzat

DonLon

Données longitudinales et répétées, pharmacométrie

12 séances

18h00

F. Mentré

Dur

Analyse des durées

10 séances

20h00

O. Bouaziz

GenStat

Génétique Statistique

10 séances/10 TD

40h00

V. Perduca

ModLG

Modèle linéaire généralisé

12 séances

18h00

J. Ph. Jais

RésBay


Réseaux bayésiens pour les données post-génomiques

4 séances/4TD

16h00

G. Nuel

V. Perduca

StatMath

Statistique mathématique

12 séances

18h00

M. Sedki

P. Tubert-Bitter

TestsMu

Tests multiples

6 séances

9h00

M. Sedki


Modules communs :


BAYES

Modélisation bayesienne

10 séances

15h00

C. Guihenneuc

Boot

Boostrap

4 séances

6h00

M. Sedki

RE

"Recherches en ....."

10 séances

15h00

J. Ph. Empana


Modules additionnels : (en choisir 1 pour la validation, mais les cours de plusieurs modules additionnels peuvent être suivis).


EC


Essais cliniques

16 séances

24h00

M. C. Le Deley

Y. de Rycke

G. Chatellier

EPID

Épidémiologie descriptive et sondages

14 séances

21h00

J. Warszawski

EQ

Epidémiologie quantitative

10 séances/4 TP

21h00

J. Bouyer

MES


Mesure en recherche clinique et épidémiologique

11 séances

16h30

J. Coste

Méta-A

Méta-Analyse

Il est possible de suivre les 2 séances de Méta-Analyse à titre « gratuit » : ce n’est pas considéré comme un module additionnel.

2 séances

3h00

G. Chatellier

J. P. Pignon

Modél.

Modélisation des Maladies infectieuses

6 séances

9h00

J. Legrand

SerC

Séries chronologiques

4 séances/4 TP

12h00

L. Watier






Master 2 de Santé Publique Spécialité Recherche en Santé Publique :




parcours "ORGANISATIONS ET SYSTEMES DE SANTE"- UE 4-2



Responsables :
Nathalie PELLETIER-FLEURY (CESP Inserm U1018 – Eq. 1),

Olivier SAINT-LARY (uvsq)

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